1994년 9월 남국현(요한) 신부가 제16대 주임신부로 부임했다. 남신부는 여러 가지 일을 구상하던 중 첫번째로 구역을 정리했다. 22개 구역을 14개 구역으로 조정하고 구역장을 모두 여성으로 교체했다. 여성의 지위를 향상시키기 위해 사목회 여성 부회장을 비롯하여 각 분과별로 여성 위원을 임명했다. 남신부는 성모상을 대성전 오른쪽 공간으로 이전했으며, 그 자리에 계단공사 및 교육관 입구 개수공사를 동시에 시공했다. 또 울대리 묘지를 보다 효율적으로 관리하기 위해 경계측량을 실시한 결과 뜻밖에도 약 6천평의 임야(묘 2천기)를 찾기도 했다. 길음동 본당 50년사 발간위원회(위원장 : 박의웅 다니엘)가 발족되어 본당설정 50년 역사를 정리했다.

 
1995년 5월 본당 설정 50주년을 맞이하여 더욱 성숙한 교회로 새 출발을 다짐
1994년 09월
본당 설정 50주년 기념행사 준비위원회 발족
1995년 02월
본당 설정 50주년 기념 구역별 척사대회
03월
본당 설정 50주년 기념 외부강사 초빙 강연회 (가정과 자녀교육),
본당 설정 50주년 기념 50일 기도문 작성
04월
본당 설정 50주년 기념 구역별 성가 경연대회, 초등부 사생대회, 중고등부 백일장
본당 설정 50주년 기념 전 신자 성찰 피정 (8일 - 9일까지)
본당 설정 50주년 기념 불우이웃돕기 구역별 바자회
본당 설정 50주년 기념 연합 성가 발표대회
05월
본당 설정 50주년 기념 경로잔치
본당 설정 50주년 기념 신앙체험 발표대회
길음동 본당 50년사 발간 및 본당 공동체의 날 김수환 추기경 미사 집전
1996년 07월
김대건 신부 유해 순회기도회
11월
청소년을 위한 ‘만남의 방’ 개관
1997년 11월
울대리 묘지관리소 준공 기념미사 봉헌
1998년 12월
신규아파트 전입 교우 환영미사(쌍용, 풍림)
1999년 07월
원영훈(세자요한) 부제 서품
10월
17대 심용섭(아우구스티노) 신부 부임
2000년 02월
신영주(도르테아) 수녀 부임
07월
원영훈(세자요한) 부제 사제 서품
2001년 10월
민명숙(루이스) 수녀 부임
12월
27대 김현규(리노) 보좌신부 부임
2002년 02월
길음동 동부아파트 전입교우 환영미사(03일)
정연화(다니엘) 수녀 부임(24일)
04월
신자재교육 (매 금요일, 10주간, 요한복음과 성사)(12일)
09월
본당의 날《찬미의 밤(14일) : 구역별 성가경연대회, 봉헌의 날(15일) : 한마당 큰잔치》(15일)
10월
본당 홈페이지 개설 (http://ch.catholic.or.kr//gilum)
2003년 01월
돈암동 동부아파트 전입교우 환영미사(05일)
02월
대보름 맞이 민속놀이(23일)
04월
길음동 삼성아파트 전입교우 환영미사(06일)
06월
체칠리아 어버이 성가대 제4회 정기연주회 겸 길음동 성가대 30주년 기념음악회(21일)
07월
만남의 날 행사(냉담자 회두)(20일)
09월
본당공동체의 날 체육대회(숭덕초등학교)(21일)
10월
김명희(김임이데레사) 수녀 부임(22일)
11월
연도 경연대회 및 기도(16일)
견진성사(220명)(23일)
12월
28대 이승주(대건안드레아) 보좌신부 부임(05일)
2004년 09월
본당의 날《지혜의 날(11일) : 인형성극, 성서가훈 전시회 봉헌의 날(12일) : 한마당 큰잔치》
최동진(베르나르도) 주임신부 부임(21일)
10월
진은아(사라) 수녀 부임(22일)
12월
29대 권구택(안드레아) 보좌신부 부임(02일)